Vnútropolitická situácia v Libanone sa začiatkom 21. storočia výrazne zmenila. Po stiahnutí Izraela z južného Libanonu a smrti bývalého prezidenta Hafeza Al-Assada v roku 2000 čelila sýrska vojenská prítomnosť kritike a odporu libanonského obyvateľstva. 14. februára 2005 bol bývalý premiér Rafik Hariri zavraždený pri výbuchu bomby v aute. . Lídri Aliancie zo 14. marca obvinili Sýriu z útoku, zatiaľ čo Sýria a Aliancia zo 8. marca tvrdili, že za atentátom stojí Izrael. Atentát na Harírího znamenal začiatok série atentátov, ktoré vyústili do smrti mnohých prominentných libanonských osobností. Atentát spustil cédrovú revolúciu, sériu demonštrácií, ktoré požadovali stiahnutie sýrskych jednotiek z Libanonu a zriadenie medzinárodnej komisie na vyšetrovať atentát. Pod tlakom Západu sa Sýria začala sťahovať a do 26. apríla 2005 sa všetci sýrski vojaci vrátili do Sýrie. Rezolúcia BR OSN č. 1595 vyzvala na vyšetrenie atentátu. Medzinárodná nezávislá vyšetrovacia komisia OSN zverejnila 20. októbra 2005 predbežné zistenia v Mehlisovej správe, v ktorej sa uvádza, že atentát bol organizovaný sýrskymi a libanonskými spravodajskými službami. 12. júla 2006 Hizballáh spustil sériu raketových útokov a náletov na izraelské územie. , kde zabili troch izraelských vojakov a dvoch ďalších zajali. Izrael odpovedal náletmi a delostreleckou paľbou na ciele v Libanone a pozemnou inváziou do južného Libanonu, čo viedlo k libanonskej vojne v roku 2006. Konflikt bol oficiálne ukončený rezolúciou BR OSN 1701 zo 14. augusta 2006, ktorá nariadila prímerie. V konflikte zahynulo približne 1191 Libanončanov a 160 Izraelčanov. Južné predmestie Bejrútu bolo ťažko poškodené izraelskými náletmi.